分子生態學(Molecular Ecology)是一本由Wiley-Blackwell Publishing Ltd出版的一本生物-進化生物學學術刊物，主要報道生物-進化生物學相關領域研究成果與實踐。本刊已入選來源期刊，屬于國際一流期刊。該刊創刊于1992年，出版周期Semimonthly。2021-2022年最新版WOS分區等級：Q1，2023年發布的影響因子為4.5，CiteScore指數8.4，SJR指數1.705。本刊非開放獲取期刊。
《分子生態學》發表利用分子遺傳技術解決生態學、進化、行為和保護等相關問題的論文。研究可能采用中性標記來推斷生態和進化過程，或直接研究生態重要基因及其產物。我們不鼓勵主要描述性且僅與所研究分類群相關的論文。報告分子標記開發、分子診斷、條形碼或 DNA 分類學或技術方法的論文應重新定向到我們的姊妹雜志《分子生態學資源》。同樣，具有強烈應用重點的論文應提交給《進化應用》。分子生態學的研究領域包括：
* 種群結構和系統地理學
* 生殖策略
* 親緣關系和親屬選擇
* 性別分配
* 群體遺傳理論
* 分析方法開發
* 保護遺傳學
* 物種形成遺傳學
* 微生物多樣性
* QTL 的進化動態
* 生態相互作用
* 分子適應和環境基因組學
* 轉基因生物的影響
| 大類學科 | 分區 | 小類學科 | 分區 | Top期刊 | 綜述期刊 |
| 生物學 | 1區 | ECOLOGY 生態學 BIOCHEMISTRY & MOLECULAR BIOLOGY 生化與分子生物學 EVOLUTIONARY BIOLOGY 進化生物學 | 1區 2區 2區 | 是 | 否 |
| 大類學科 | 分區 | 小類學科 | 分區 | Top期刊 | 綜述期刊 |
| 生物學 | 1區 | BIOCHEMISTRY & MOLECULAR BIOLOGY 生化與分子生物學 ECOLOGY 生態學 EVOLUTIONARY BIOLOGY 進化生物學 | 1區 2區 2區 | 是 | 否 |
| 大類學科 | 分區 | 小類學科 | 分區 | Top期刊 | 綜述期刊 |
| 生物學 | 1區 | BIOCHEMISTRY & MOLECULAR BIOLOGY 生化與分子生物學 ECOLOGY 生態學 EVOLUTIONARY BIOLOGY 進化生物學 | 1區 1區 2區 | 是 | 否 |
| 大類學科 | 分區 | 小類學科 | 分區 | Top期刊 | 綜述期刊 |
| 生物 | 2區 | BIOCHEMISTRY & MOLECULAR BIOLOGY 生化與分子生物學 ECOLOGY 生態學 EVOLUTIONARY BIOLOGY 進化生物學 | 2區 2區 2區 | 否 | 否 |
| 大類學科 | 分區 | 小類學科 | 分區 | Top期刊 | 綜述期刊 |
| 生物學 | 1區 | BIOCHEMISTRY & MOLECULAR BIOLOGY 生化與分子生物學 ECOLOGY 生態學 EVOLUTIONARY BIOLOGY 進化生物學 | 1區 1區 2區 | 是 | 否 |
| 大類學科 | 分區 | 小類學科 | 分區 | Top期刊 | 綜述期刊 |
| 生物學 | 1區 | BIOCHEMISTRY & MOLECULAR BIOLOGY 生化與分子生物學 ECOLOGY 生態學 EVOLUTIONARY BIOLOGY 進化生物學 | 1區 1區 1區 | 是 | 否 |
中科院JCR期刊分區（又稱分區表、分區數據）是中國科學院文獻情報中心世界科學前沿分析中心的科學研究成果。在中科院期刊分區表中，主要參考3年平均IF作為學術影響力，最終每個分區的期刊累積學術影響力是相同的，各區的期刊數量由高到底呈金字塔式分布。
| 按JIF指標學科分區 | 收錄子集 | 分區 | 排名 | 百分位 |
| 學科：BIOCHEMISTRY & MOLECULAR BIOLOGY | SCIE | Q1 | 76 / 313 |
75.9%
|
| 學科：ECOLOGY | SCIE | Q1 | 30 / 195 |
84.9%
|
| 學科：EVOLUTIONARY BIOLOGY | SCIE | Q1 | 8 / 54 |
86.1%
|
| 按JCI指標學科分區 | 收錄子集 | 分區 | 排名 | 百分位 |
| 學科：BIOCHEMISTRY & MOLECULAR BIOLOGY | SCIE | Q1 | 56 / 313 |
82.27%
|
| 學科：ECOLOGY | SCIE | Q1 | 34 / 195 |
82.82%
|
| 學科：EVOLUTIONARY BIOLOGY | SCIE | Q1 | 10 / 54 |
82.41%
|
湯森路透每年出版一本《期刊引用報告》（Journal Citation Reports，簡稱JCR）。JCR對86000多種SCI期刊的影響因子（Impact Factor）等指數加以統計。JCR將收錄期刊分為176個不同學科類別在JCR的Journal Ranking中，主要參考當年IF，最終每個分區的期刊數量是均分的。
| 學科類別 | 分區 | 排名 | 百分位 |
| 大類：Agricultural and Biological Sciences 小類：Ecology, Evolution, Behavior and Systematics | Q1 | 54 / 721 |
92%
|
| 大類：Agricultural and Biological Sciences 小類：Genetics | Q1 | 65 / 347 |
81%
|
CiteScore：該指標由Elsevier于2016年提出，指期刊發表的單篇文章平均被引用次數。CiteScorer的計算方式是：例如，某期刊2022年CiteScore的計算方法是該期刊在2019年、2020年和2021年發表的文章在2022年獲得的被引次數，除以該期刊2019年、2020年和2021發表并收錄于Scopus中的文章數量總和。
| 文章名稱 | 引用次數 |
| 期刊名稱 | 引用次數 |
| 期刊名稱 | 引用次數 |
| 國家/地區名 | 數量 |
| 機構名 | 數量 |
中科院分區 4區 JCR分區 Q2
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中科院分區 4區 JCR分區 Q4
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中科院分區 1區 JCR分區 Q1
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中科院分區 3區 JCR分區 Q3
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中科院分區 2區 JCR分區 Q1
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中科院分區 2區 JCR分區 Q1
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