化學信息學論文精品(七篇)

序論：寫作是一種深度的自我表達。它要求我們深入探索自己的思想和情感，挖掘那些隱藏在內心深處的真相，好投稿為您帶來了七篇化學信息學論文范文，愿它們成為您寫作過程中的靈感催化劑，助力您的創作。

篇(1)

英文名稱：Chinese Heart Journal

主管單位：第四軍醫大學

主辦單位：第四軍醫大學;中國保健醫學會心臟學會;中國醫藥信息學會心功能學會

出版周期：雙月刊

出版地址：陜西省西安市

語

種：中文

開

本：大16開

國際刊號：1009-7236

國內刊號：61-1268/R

郵發代號：52-131

發行范圍：國內外統一發行

創刊時間：1989

期刊收錄：

CA 化學文摘(美)(2009)

核心期刊：

期刊榮譽：

Caj-cd規范獲獎期刊

聯系方式

期刊簡介

篇(2)

以省市教育現代化建設發展為契機，學習、樹立、落實科學發展觀，用教育信息化帶動教育現代化。電教中心以振奮精神、實事求是、腳踏實地、全心服務于教育的工作姿態，以“扎實研究，實用培訓，嚴格管理，優質服務”為載體，促進新課改的深入，促進教師信息素質的提高和專職骨干教師隊伍形成，促進教育教學質量的提升，為秦淮教育做出貢獻。

二、主要工作：

（一）課題引領，教科研并重，扎實推進教育技術工作

1、做好省級教育技術實驗學?！笆濉彪娊陶n題結題工作

省級教育技術實驗學校，示范學校要加強“窗口學?！钡氖痉蹲饔?，加強研究成果的宣傳與推廣，并將有關教育技術活動上傳到市教育技術研究網上。必須謀劃“十一·五”課題的申報工作。

2、加強信息學科教學研究，強化學科管理

（1）積極參與學科教學視導，深入學校聽課調研、課堂教學，學生學習狀況，教研組建設和管理等現狀，特別組織好高中新課程標準的學習，落實、計劃組織全區高中研究課兩次。

（2）針對新學期小學、初中、高中信息學科教材重新變動，每兩周組織一次有效的教研活動，做到有計劃，有目的，有實效和有反饋，通過集體備課，專題講座，觀摩研討等活動，加強教師們之間的交流合作，解決實際問題，安排全區小學研究課兩次，初中研究課一次。

（3）組織小學信息學教研片，將以東片和西片（含城外）設立片級教研網，確定東、西片召集人，并開展片級活動。

（4）組織好高二信息技術省級“會考”工作（10月15日~16日）

（5）組織小學、中學信息學科優質課評比，推薦優秀選手參加市比賽。

3、積極探索信息技術與學科整合

網絡環境下的課堂教學是課堂教學信息化的一種模式，有利于學生自主學習、知識重建和探究性學習等作用。各校要充分發揮網絡（機房）作用，利用現有教學資源，進行網絡環境下的“教”與“學”，本學期全區小學、幼兒園分別進行網絡下的學科“整合”研討活動。

（二）繼續開展教師培訓，提高教師應用教育技術的技能

1、舉辦中小學幼兒園教師課件（網件）制作培訓班，要求，每校推薦一名教師，第三周報名，第四周開班，上課時間每周二下午2：00－5：00，培訓，資料費150元/人。

2、組織部分教師參加市、省級網絡管理培訓班，主要對象是專職計算機教師，并逐步實現網管教師“持證上崗”。

3、配合有關學校的校本培訓工作，包括提供技術指導及專題性講座等。

（三）加強管理，優質服務，做好教育信息化工作

1、繼續及時維護、更新秦淮教育網站（含進修學校的網站），繼續推進網上“政務辦公”和資料、信息的網上傳遞。宣傳秦淮教育動態、信息、配合區教育局城域網站的籌建工作。

2、積極配合基層學校寬帶接入工作和學校網站（網頁）制作，進一步強化“教育一線通”的信息應用工作。

3、督促、檢查學?！拔拿骶W絡室”開放工作，提倡周六，周日讓學生“進機房，用機房”。指導各校抓好信息技術的課外活動。

4、加強資源建設，做好“信息資源費”的收費工作。充分用好“一費制”中的“信息資料建設費”政策，為各學校征訂有用、實用的電教教材軟件。各學校要嚴格執行義務教育階段學生文字教材中配套磁帶（小學三年級－六年級，初中學生）的征訂工作，要嚴格執行資源建設費，（原電教代辦費中80%部分，即小學4.8元/人、中學(含高中）6.4元/人)的收繳工作，力求做到開學后一個月內上交區進修學校會計室。各學校的信息技術費，在帳目上要設獨立科目，做到專款專用，年底對信息技術費的使用進行抽檢，違規學校不予年審或取消收費資格。

（四）幾項重要工作

1、組織全區教育技術（電教）論文的評比工作（9月25日截止），推薦優秀論文參加市級評比。

2、市中小學網絡文明夏令營的活動總結表彰工作。

3、市、區中小學信息技術與課程整合教學設計暨CAI優秀教案（課件）評比表彰會。

篇(3)

[論文摘要]生物信息學是80年代以來新興的一門邊緣學科，信息在其中具有廣闊的前景。伴隨著人類基因組計劃的勝利完成與生物信息學的發展有著密不可分的聯系，生物信息學的發展為生命科學的發展為生命科學的研究帶來了諸多的便利，對此作了簡單的分析。

一、生物信息學的產生

21世紀是生命科學的世紀，伴隨著人類基因組計劃的勝利完成，與此同時，諸如大腸桿菌、結核桿菌、啤酒酵母、線蟲、果蠅、小鼠、擬南芥、水稻、玉米等等其它一些模式生物的基因組計劃也都相繼完成或正在順利進行。人類基因組以及其它模式生物基因組計劃的全面實施，使分子生物數據以爆炸性速度增長。在計算機科學領域，按照摩爾定律飛速前進的計算機硬件，以及逐步受到各國政府重視的信息高速公路計劃的實施，為生物信息資源的研究和應用帶來了福音。及時、充分、有效地利用網絡上不斷增長的生物信息數據庫資源，已經成為生命科學和生物技術研究開發的必要手段，從而誕生了生物信息學。

二、生物信息學研究內容

（一）序列比對

比較兩個或兩個以上符號序列的相似性或不相似性。序列比對是生物信息學的基礎。兩個序列的比對現在已有較成熟的動態規劃算法，以及在此基礎上編寫的比對軟件包BALST和FASTA，可以免費下載使用。這些軟件在數據庫查詢和搜索中有重要的應用。有時兩個序列總體并不很相似，但某些局部片斷相似性很高。Smith-Waterman算法是解決局部比對的好算法，缺點是速度較慢。兩個以上序列的多重序列比對目前還缺乏快速而又十分有效的算法。

（二）結構比對

比較兩個或兩個以上蛋白質分子空間結構的相似性或不相似性。

（三）蛋白質結構預測

從方法上來看有演繹法和歸納法兩種途徑。前者主要是從一些基本原理或假設出發來預測和研究蛋白質的結構和折疊過程。分子力學和分子動力學屬這一范疇。后者主要是從觀察和總結已知結構的蛋白質結構規律出發來預測未知蛋白質的結構。同源模建和指認（Threading）方法屬于這一范疇。雖然經過30余年的努力，蛋白結構預測研究現狀遠遠不能滿足實際需要。

（四）計算機輔助基因識別

給定基因組序列后，正確識別基因的范圍和在基因組序列中的精確位置.這是最重要的課題之一，而且越來越重要。經過20余年的努力，提出了數十種算法，有十種左右重要的算法和相應軟件上網提供免費服務。原核生物計算機輔助基因識別相對容易些，結果好一些。從具有較多內含子的真核生物基因組序列中正確識別出起始密碼子、剪切位點和終止密碼子，是個相當困難的問題，研究現狀不能令人滿意，仍有大量的工作要做。

（五）非編碼區分析和DNA語言研究

在人類基因組中，編碼部分進展總序列的3－5%，其它通常稱為“垃圾”DNA，其實一點也不是垃圾，只是我們暫時還不知道其重要的功能。分析非編碼區DNA序列需要大膽的想象和嶄新的研究思路和方法。DNA序列作為一種遺傳語言，不僅體現在編碼序列之中，而且隱含在非編碼序列之中。

三、生物信息學的新技術

（一）Lipshutz(Affymetrix,Santaclara,CA,USA)

描述了一種利用DNA探針陣列進行基因組研究的方法，其原理是通過更有效有作圖、表達檢測和多態性篩選方法，可以實現對人類基因組的測序。光介導的化學合成法被應用于制造小型化的高密度寡核苷酸探針的陣列，這種通過軟件包件設計的寡核苷酸探針陣列可用于多態性篩查、基因分型和表達檢測。然后這些陣列就可以直接用于并行DNA雜交分析，以獲得序列、表達和基因分型信息。Milosavljevic(CuraGen,Branford,CT,USA)介紹了一種新的基于專用定量表達分析方法的基因表達檢測系統，以及一種發現基因的系統GeneScape。為了有效地抽樣表達，特意制作片段模式以了解特定基因的子序列的發生和冗余程度。他在酵母差異基因表達的大規模研究中對該技術的性能進行了驗證，并論述了技術在基因的表達、生物學功能以及疾病的基礎研究中的應用。（二）基因的功能分析

Overton(UniversityofPennsylvaniaSchoolofMedicine,Philadelphia,PA,USA)論述了人類基因組計劃的下一階段的任務基因組水平的基因功能分析。這一階段產生的數據的分析、管理和可視性將毫無疑問地比第一階段更為復雜。他介紹了一種用于脊椎動物造血系統紅系發生的功能分析的原型系統E-poDB，它包括了用于集成數據資源的Kleisli系統和建立internet或intranet上視覺化工具的bioWidget圖形用戶界面。EpoDB有可能指導實驗人員發現不可能用傳統實驗方法得到的紅系發育的新的藥物靶，制藥業所感興趣的是全新的藥物靶，EpoDB提供了這樣一個機會，這可能是它最令人激動的地方。

Babbitt(UniversityofCalifornia,SanFrancisco,CA,USA)討論了通過數據庫搜索來識別遠緣蛋白質的方法。對蛋白質超家族的結構和功能的相互依賴性的理解，要求了解自然所塑造的一個特定結構模板的隱含限制。蛋白質結構之間的最有趣的關系經常在分歧的序列中得以表現，因而區分得分低（low-scoring）但生物學關系顯著的序列與得分高而生物學關系較不顯著的序列是重要的。Babbit證明了通過使用BLAST檢索，可以在數據庫搜索所得的低得分區識別遠緣關系（distantrelationship）。Levitt(Stanforduniveersity,PaloAlto,CA,USA)討論了蛋白質結構預測和一種僅從序列數據對功能自動模建的方法?；蚬δ苋Q于基因編碼的蛋白質的三級結構，但數據庫中蛋白質序列的數目每18個月翻一番。為了確定這些序列的功能，結構必須確定。同源模建和從頭折疊（abinitiofolding）方法是兩種現有的互為補充的蛋白質結構預測方法；同源模建是通過片段匹配（segmentmatching）來完成的，計算機程棄SegMod就是基于同源模建方法的。

（三）新的數據工具

Letovsky(JohnshopkinsUniversity,Baltimore,MD,USA)介紹了GDB數據庫，它由每條人類染色體的許多不同圖譜組成，包括細胞遺傳學、遺傳學、放射雜交和序列標簽位點（STS）的內容，以及由不同研究者用同種方法得到的圖譜。就位置查詢而言，如果不論其類型（type）和來源（source），或者是否它們正好包含用以批定感興趣的區域的標志（markers），能夠搜索所有圖譜是有用的。為此目的，該數據庫使用了一種公用坐標系統（commoncoordinatesystem）來排列這些圖譜。數據庫還提供了一張高分辨率的和與其他圖譜共享許多標志的圖譜作為標準。共享標志的標之間的對應性容許同等于所有其它圖譜的標準圖譜的分配。

Candlin(PEappliedBiosystems,FosterCity,CA,USA)介紹了一種新的存儲直接來自ABⅠPrismdNA測序儀的數據的關系數據庫系統BioLIMS。該系統可以與其它測序儀的數據集成，并可方便地與其它軟件包自動調用，為測序儀與序列數據的集成提供了一種開放的、可擴展的生物信息學平臺。

參考文獻：

篇(4)

材料的計算模擬方法介紹

材料的計算模擬研究是近年來飛速發展的一門新興學科和交叉學科．它綜合凝聚態物理學、理論化學、材料物理學和計算機算法等多個相關學科．它的目的是利用現代高速計算機，模擬材料的各種物理化學性質，深入理解材料從微觀到宏觀多個尺度的各類現象與性能，并對材料的結構和物性進行理論預言，從而達到設計和開發新材料的目的．材料的多尺度計算模擬方法主要有以下幾種:

(1)第一性原理計算方法(First－principlesMethods)基于密度泛函理論的第一性原理計算方法是目前研究微觀電子結構最主要的理論方法．第一性原理計算方法只用到普朗克常數(h)，玻爾茲曼常數(kB)，光速(c)，電子靜態質量(m0)和電子電荷電量(e)這5個基本物理變量和研究體系的基本結構．從量子力學出發，通過數值求解薛定諤方程，計算材料的物理性質．在密度泛函理論，局域密度近似(LDA)和廣義梯度近似(GGA)框架下的計算已廣泛應用于第一性原理的電子結構研究中，并已經取得很大的成功．結合一些能帶結構計算的方法，對于半導體和一些金屬基態性質，如晶格常數，晶體結合能，晶體力學性質都能夠給出與實驗符合得很好的結果，同時能夠比較精確地描述很多體系的電子結構(如能帶結構、電子態密度、電荷密度、差分電荷密度和鍵布局等)、光學性質(介電函數、復折射率、光吸收系數、反射光譜及光電導等)和磁性質，從微觀理論角度分析和揭示材料物理性質的起源，使實驗者主動對材料進行結構和功能的控制，以便按照需求制備新材料．

(2)分子動力學方法(MolecularDynamicsMethods)分子動力學是一種確定性方法，是按照該體系內部的內稟動力學規律來確定位形的轉變，跟蹤系統中每個粒子的個體運動，然后根據統計物理規律，給出微觀量(分子的坐標、速度)與宏觀可觀測量(壓力、溫度、比熱容、彈性模量等)的關系來研究材料性能的一種方法[5]．分子動力學方法首先需要建立系統內一組分子的運動方程，通過求解所有分子的運動方程，來研究該體系與微觀量相關的基本過程．對于這種多體問題的嚴格求解，需要建立并求解體系的薛定諤方程．根據波恩－奧本海默近似，將電子的運動與原子核的運動分開來處理，電子的運動利用量子力學的方法處理，而原子核的運動則使用經典動力學方法處理．此時原子核的運動滿足經典力學規律，用牛頓定律來描述，這對于大多數材料來說是一個很好的近似．只有處理一些較輕的原子和分子的平動、轉動或振動頻率γ滿足hγ＞kBT時，才需要考慮量子效應．

(3)蒙特卡洛方法(MonteCarloMethods)蒙特卡洛方法是在簡單的理論準則基礎上(如簡單的物質與物質或者物質與環境相互作用)，采用反復隨機抽樣的手段，解決復雜系統的問題．該方法采用隨機抽樣的手法，可以模擬對象的概率與統計的問題．通過設計適當的概率模型，該方法還可以解決確定性問題，如定積分等．隨著計算機的迅速發展，蒙特卡洛方法已在材料、固體物理、應用物理、化學等領域得到廣泛的應用[6]．蒙特卡洛方法可以通過隨機抽樣的方法模擬材料構成基本粒子原子和分子的狀態，省去量子力學和分子動力學的復雜計算，可以模擬很大的體系．結合統計物理的方法，蒙特卡洛方法能夠建立基本粒子的狀態與材料宏觀性能的關系，是研究材料性能及其影響因素的本質的重要手段．

材料專業引入計算模擬教學的探索

材料計算的目的在于理解和發現新的材料性能及其物理本質．計算已經與實驗和形式理論一樣成為材料研究的3大支柱之一．為學生將來能夠有更高的起點研究材料科學，適應新形勢下材料研究方法，培養具有寬廣材料科學基礎，掌握材料現代研究手段的“寬口徑、厚基礎、強能力、高素質”的材料科學專業人才．我們在本科教學階段就應該有計劃的引入和加強計算模擬方法的教學．采用的教學形式可以結合實際情況，靈活的應用．近年來我們采取的教學方式主要有以下3種方式:(1)開設計算材料學類課程在2006年物理與電子信息學院材料物理與化學專業培養方案中已經確定《計算機在材料科學中的應用》和《計算物理》課程為專業選修課程，學時分別為36學時和54學時．《計算機在材料科學中的應用》課程偏重實踐教學，通過上機操作學習計算軟件的基本原理和使用方法．主要教學內容包括:材料學的發展現狀及計算機在材料科學與工程中的應用;材料科學研究中的數學模型;材料科學研究中常用的數值分析方法;材料科學研究中主要物理場的數值模擬;材料科學與行為工藝的計算機模擬;材料數據庫和新材料、新合金的設計;材料加工過程的計算機控制;計算機在材料檢測中的應用;材料研究科學中的數據和圖像處理;互聯網在材料科學研究中的應用等9部分內容，基本涵蓋當今計算機技術在材料科學研究中應用的各個方面．《計算物理》課程則以理論教學為主，偏重物理基本原理的介紹．主要教學內容包括:計算物理學發展的最新狀況;蒙特卡洛方法及其若干應用;有限差分方法;分子動力學方法;密度泛函理論;計算機代數;高性能計算和并行算法等8部分內容．計算材料類課程的開設注重理論和實踐并重的原則，在講解基本原理的同時加強學生動手上機實踐能力的培養，因此，經過課程的學習，學生已經初步具備利用計算機進行材料模擬的能力．部分選修計算材料類課程的同學在學習中對計算模擬產生了極大的興趣，在大四時選擇材料計算相關課題作為本科畢業論文選題．例如，08屆學生的畢業論文《ZnS摻雜Cu光學性質的第一性原理研究》和《布朗運動的蒙特卡洛模擬》，09屆學生的畢業論文《ZnO電子結構和光學性質的研究》，11屆學生的畢業論文《晶格熱容的理論計算》和《簡立方晶體結構能量分布的理論模擬》等均為材料計算和模擬相關課題，并且有多人的畢業論文被評為優秀畢業論文．個別優秀的學生讀研后繼續從事材料的計算模擬相關研究．通過幾年的教學實踐，計算材料相關課程的開設對于擴大學生的知識面，提高學生的理論分析能力有極大地幫助．(2)在材料相關的理論課程中加入計算模擬方法介紹雖然已經在材料專業開設《計算機在材料科學中的應用》和《計算物理》等材料計算相關的課程，但這兩門課均為專業選修課，只有選修相關課程的學生才能得到相應的計算模擬培訓，受眾面還比較窄．因此，為使更多的學生了解到材料模擬計算的相關理論和知識，在材料專業主干課的教學中也適時地加入相關的計算模擬方法的介紹，從而擴大計算模擬知識的普及面．例如，在《固體物理》課程中，當講解到能帶理論一章時，我們會在本章結束時，加入一次課，著重介紹基于第一性原理的平面波贗勢計算方法計算材料的能帶結構、電子態密度等以及第一性原理計算的常用軟件(CASTEP、VASP等)．一方面，對學生學習的理論知識加以直觀化和適度的擴展，另一方面也進一步普及第一性原理計算的相關知識．在《材料科學基礎》教學中講解到相平衡與相圖一章時，我們會在本章內容結束后介紹相圖計算近年來的發展現狀，包括CALPHAD(CalculationofPhaseDiagram)計算方法、熱力學與動力學的結合、第一性原理與相圖計算方法的結合，并簡要介紹今后相圖計算可能的發展方向[7]．在晶體缺陷內容的教學中，穿插介紹利用分子動力學計算面心立方金屬空位和間隙原子點缺陷的形成能的方法．通過在課程教學中穿插入計算模擬方法的介紹，一方面也加深了學生對所學內容的理解，另一方面開闊了學生的眼界．(3)舉辦計算模擬相關的學術講座．自從2009年以來，物理與電子信息學院從事計算模擬研究的教師每學期都結合自身的科研情況舉辦面向全院學生的學術講座．例如在2011至2012學年第二學期，我們舉辦兩場學術講座，分別是《氧化鋅晶體及其摻雜的第一性原理研究》以及《可見光響應半導體光催化材料的結構和能帶設計》，教師在講座中介紹自己的科研情況，同時也使學生了解到如何把學到的計算模擬知識應用到科研實踐中去，讓學生體會到如何利用計算模擬預測材料的物理性質以及指導材料設計的研究方式，提高學生自覺學習計算模擬方法的積極性．

結束語

篇(5)

“國家優秀自費留學生獎學金”從2005年設立至今，已評選了三屆。該獎項已經成為祖國關愛自費留學生的知名品牌，受到國內外權威媒體和有關人士的普遍關注和廣泛贊譽。

廣大自費留學生是國家寶貴的人才資源，為了進一步加強他們與祖國的聯系，弘揚優秀自費留學人員奮力拼搏的精神，本刊從2006年第1期開始，向廣大讀者介紹部分獲獎者。同時近期我們又開辟了“我的自費留學經歷”專題，真誠歡迎更多的自費留學生將你們留學中的酸甜苦辣與心得寫給我們。

本欄目聯系電話：010-62257722轉208

傳真：010-62252501

電子信箱：baiyu48@sina．com

葉海濤，2003年獲獎者，留學英國。現任英國倫敦大學學院(UCL)納米研究中心博士后研究員，與勞斯萊斯公司(Rolls-Royce plc)合作共同研發飛機引擎內部的高溫功率放大器。1998年西安交通大學本科畢業，曾獲得“好來西”企業獎學金、首屆美國聯合科技公司(UTC)容閎科技教育獎。2000年新加坡南洋理工大學(NTU)碩士畢業，獲新加坡Tan Chin Tuan國際交流獎學金及李氏基金(Lee Foundation)。2004年英國倫敦大學博士畢業，主要專業方向為金剛石由子學及納米器件2004～2005年被聘為日本電信電話株式會社國際研究員，從事單晶金剛石場效應管的研發。現已發表國際期刊論文20多篇及國際會議論文40多篇，多次應邀參加國際學術會議并做大會專題報告。在攻讀博士期間，連續三年榮獲英國大學校長委員會頒發的海外研究生獎學金(ORS)、英國EPSRC獎學金和香港王寬成獎學金(KCWong)，并被吸收為英國材料學會(IOM3)(2000年)、英國物理學會(10P)(2001年)及英國電子工程師學會(IEE)的會員，(2003年、2006)年當選為旅英中國工程師協會的理事，并應邀成為以色列國家科學基金委的特約評審人。

而立之年的葉海濤表示：“一定不會辜負祖國的期望，不斷提升和完善自己，腳踏實地做好每一份工作，心系祖國，愿為祖國的繁榮和發展貢獻自己的青春和智慧?！?/p>

謝向華，2004年獲獎者，留學英國。2000年畢業于上海同濟大學環境科學與工程學院，2001年9月赴英國布里斯托爾大學攻讀計算機碩士學位，一年后順利完成“高級計算科學”課程，并獲得理學碩士學位。2003年11月開始在布里斯托爾大學計算機科學系媒體計算科研小組攻讀博士學位，同時擔任“研究助理”一職從事科研工作。2006年3月通過博士論文答辯。自2006年2月起，在布里斯托爾大學計算機系做博士后，從事一項由歐盟委員會(European Commission)資助的旨在開發幫助盲人和視力嚴重損傷的病人與外界交互的計算機認知系統的研究項目(CASBliP)。其研究主要為立體計算機視覺系統，動態曲線分割模型，計算機材質分析，自動缺陷識別和醫學圖像。他在計算機視覺與圖形處理領域的國際性刊物和國際性學術研討會上以第一作者發表了10多篇論文。2004年，應美國瑪柯尼醫療系統(Marconi Medical System，Inc．)蘇里博士的邀請，在《醫學圖像分析手冊高級圖形分割與圖像注冊模型》一書中撰寫章節――“區域支持的幾何彩色動態曲線分割模型”。謝向華現參與《材質分析手冊》一書的編撰工作，該書將于2007年出版。2006年初，他與默曼迪博士的PRINS研究方案得到了英國Levelhulm研究基金會為期兩年的資助。他現擔任多個國際性學術期刊的評委，并是英國“醫學圖像分析與認知”年會等多個國際性學術協會的會員。謝向華認為，獲得“國家優秀自費留學生獎學金”是祖國對自己在海外多年努力學習的莫大鼓勵與肯定，同時也讓所有海外的莘莘學子看到祖國對于他們的重視與厚望。在今后的研究工作中，他將繼續努力學習尖端技術，為祖國將來的科技發展貢獻微薄之力。

姚小軍，2004年獲獎者，留學法國，研究方向為化學信息學。1994年就讀于蘭州大學化學系，2002年1月獲“促進科學技術研究中法協會信息科學獎學金”資助，作為蘭州大學與巴黎第七大學聯合培養的博士生，赴法國留學，師從法國巴黎第七大學ITODYS研究所化學信息學和分子模型實驗室主任范波濤教授和蘭州大學胡之德教授。在范教授和胡教授的共同指導下，主要開展了以下兩個方面的研究：(1)新的機器學習算法在QSAR／QSPR中的應用；(2)計算機輔助分子設計。他在國際知名學術刊物上發表了30余篇論文并被多次引用，所做的工作曾多次在國際會議上介紹，得到了同行的廣泛好評。留學法國期間，曾獲得2002年“法國華人青年企業家協會”教育基金會第二屆“優秀中國留學人員獎”和2004年中國國家留學基金委“國家優秀自費留學生獎學金”以及2005年“促進科學技術研究中法協會信息科學獎”。2004年12月獲得博士學位。獲得學位后，姚小軍響應國家西部大開發戰略，懷著對母校的深厚感情，決定回到蘭州大學，從事教學和科研工作，為國家的西部大開發戰略和母校的發展貢獻自己的力量。獲獎后，他深深地感謝國家對海外留學生的關心和支持。他表示將會繼續努力，爭取更大的成績，更好地報效國家。

篇(6)

明晰學生特點，構建適合學生發展的課程

創立我校理科實驗班，陸續培養出國際奧賽金牌、國家集訓隊成員、高考理科狀元。每年約有3名學生獲得北大校長實名制和清華領軍計劃的推薦。每年有數十人次在北京市和全國數學、物理、化學、生物、信息學科競賽中獲獎。高考成績名列北京市前茅，為高等學校培養了一批批高素質的理科預備人才。理科實驗班的成績得到了學生、家長和社會的廣泛稱贊。

理科實驗班的學生有其自身的特點，優勢表現突出：智力和能力水平高于同齡人，喜歡獨立思考，善于做出決策；有很強的接受力，愿意主動地接受挑戰和戰勝挑戰；具有優良的學習品質，意志力強，在數理學科方面有興趣，優勢潛能明顯，對未來的發展有追求。理科實驗班的學生不足表現明顯：需要加強人文情懷的培養，形象思維能力不足；閱讀與寫作能力有待提高；樂群性不足，傾向于少參與社交活動、不偏好與人打交道的心理狀態。

在高質量、校本化完成國家課程的基礎上，學校構建出適合學生特點，滿足學生需求，促進學生全面而有個性發展的理科實驗班課程體系，開設的課程有：拓展課程、競賽課程、專修課程、講座課程、研究性課程和科技與人文社會實踐課程等特選課程。

培養人文情懷，突出數理學科“高精實”的特色

學校制定的《理科實驗班課程改革方案》中明確指出：針對學生特點，加強人文情懷的培養，堅持注重啟發、引導，靈活運用“問題推進”和“啟發探究”的教學模式，在高質量地完成國家規定的必修必選課程的基礎上，突出數理學科“高精實”的特色。

1.加強人文學科課程建設

首先，開設語文和英語的《閱讀與寫作》專修課程，如《英文小說閱讀》、《中文寫作指導》等，加強閱讀與寫作方法指導，拓展中英文閱讀范圍，培養良好的閱讀與寫作習慣，提升學生的閱讀與寫作能力，為今后閱讀大量中外文獻和撰寫論文奠定基礎。其次，整合歷史、地理、政治等學科知識，突出構建知識結構，采用自主學習，讀、講、議、練相結合的方式，充分發揮學生的主體參與熱情，提升形象思維能力，培養學生分析問題的全面性和綜合性，使學生關注社會生活，正確地看待社會現象。

近3年，學生個人和小組撰寫的課題有12篇在各類刊物上發表，22篇論文獲區、市和國家級獎勵，學生個人出版書籍10余部，如2010屆金一娜出版了《我同時考上了清華和伯克利》，學生的人文情懷得到提升。

2.突出數理學科“高精實”的特色

理科實驗班學生善于提出問題，喜歡獨立思考。因此，補充、整合和深化數理學科專業知識十分必要。主要的方式有：以專題形式呈現，通過學生自主學習、啟發探究、合作交流，邀請專家指導，提高分析問題和解決問題的能力。部分學科“高精實”特選課程

近3年，理科實驗班學生參加全國中學生學科競賽榮獲一、二等獎人數達46人次；參加全國及北京市科技創新大賽榮獲一等獎的課題有4個，二等獎的課題有6個。這種有針對性地設置不同類別的特選課程，實現了學生的興趣和優勢潛能匹配，滿足了學生的多元需求，凸顯出理科實驗班在數理學科“高精實”的特色。

開設特選課程，探索創新人才的培養

“為什么我們的學?？偸桥囵B不出杰出人才？”這是錢老多次提出的問題。我校理科實驗班有一批具備創新潛質的學生，學校一直堅持探索創新人才的培養。通過開設大學先修課程和研究性課程，借助大學先進的教學手段和個性化的指導，激活有潛質學生的發展內動力，培養他們的創新人格與創新思維，為他們今后在某些領域的可持續性發展奠定基礎。

1.大學先修課程

通過“大學先修課程”給予潛質學生更高的學術挑戰，增加學生對學科的分析型思考，幫助他們順利實現從高中到大學在學術和心理層面的過渡，從而增加在大學的成功機會。通過多次調研、論證，我們將逐步開設《中國文學史》、《微積分AB》、《英語語言學入門》、《普通物理》、《化學原理》、《生命科學導論》等課程，將大學的教授請到高中來授課，形成高中課程與大學課程的有機銜接，使高中的教育更具有連續性、延展性。

2.研究性課程

研究性課程是學生根據自身的興趣、志向提出學習研究方向，教師根據學生發展方向，采用任務驅動式的教學，通過自學、集體討論、導師指導、成果展示等方法，完成學習任務的一門個性化指導課程。

研究性課程側重兩方面發展，一是學科專業的深入發展，著重對數學、物理、化學、生物和信息學科進行專業書籍的指導閱讀，加強專題系列的實驗操作，通過學生間的閱讀交流、實驗互動，滿足學科專長的發展，聚焦屬于自己領域的學習。二是研究性學習的拓展，在高質量完成研究性學習課程的基礎上，指導學生與專家接觸，與大學實驗室建立聯系，聯合培養，提升他們的科研能力和創新能力。

通過“研究性課程”為具有特殊發展潛質的學生制定個性化的培養方案，讓指導教師有自己的得意門生，讓學生的特長獲得充分發展，為創新人才的成長創造條件，同時也促進了指導教師的專業成長，培養出一批專業知識深厚的任課教師。

開展豐富實踐活動，全面提升綜合素質

長期以來，理科實驗班堅持做好個性化的社區服務和長短期相結合、科技與人文相結合的社會實踐活動，培養學生的社會服務意識，使學生具有高度的社會責任感，激發學生崇尚科學、追求真理。

篇(7)

2006年，第二次全國殘疾人抽樣調查結果顯示，關節病是目前我國肢體致殘的兩大主要原因之一，遠遠高于脊髓灰質炎、腦癱及交通事故等，而在這些關節病中類風濕性關節炎（RA）的致殘率高居首位。RA是我國常見的一種慢性致殘性自身免疫病，相關專家預計，目前我國類風濕關節炎患者超過440萬人。遺憾的是，大量患者未得到規范有效的治療。

張鵬，中國科學院深圳先進技術研究院轉化醫學研究與發展中心執行主任，師從我國著名骨科專家戴尅戎院士，主攻類風濕性關節炎發病機理和治療。

作為知名骨科專家秦嶺教授領導的轉化醫學中心的核心成員，張鵬博士研究團隊以骨科炎癥性疾病為研究重點，從病因、發病機理、治療以及康復等方面進行系統研發。以對發病機理的探討作為基礎研究提升水平的基石，以對該類疾病治療手段的創新以及相關產品或技術的臨床應用和產業化作為最高目標，以服務廣大骨科患者作為宗旨，正在走一條具有自身特色的骨科轉化研發之路。

“老藥新用”，攻堅類風濕

張鵬曾在導師戴尅戎院士的指導下，在國際上首次驗證了手術懸吊方式刺激迷走神經進而激活“膽堿能抗炎通路”對于RA模型早期炎癥發展的抑制作用。研究結果發表在SCI 期刊《Inflammation Research》上。隨后該論文陸續被《Nature Review Rheumatology》和《Nature Review Immunology》等高端雜志引用，截至目前該文章已被引用11次。

針對目前全球范圍內新藥研發遇到“冷冬”的大環境，張鵬課題組聯合計算機化學及生物信息學相關的專家，通過計算機輔助藥物預測結合目前骨關節炎基礎研究中的最新成果，在臨床用藥中篩選具有治療RA及骨關節炎等疾病的藥物新功效，即“老藥新用”在骨關節炎癥中的應用。

張鵬曾在《Inflammation Research》、《Therapeutic Advances in Musculoskeletal Disease》、《ScientificWorldJournal》等雜志發表文章，闡述了RA治療中的“老藥新用”策略：以膽堿能受體作為潛在的治療靶點，通過應用最新的藥物靶點檢索手段—“蛋白質折疊碼”技術，在臨床用藥中篩選新的抗風濕功效，進而通過臨床前實驗手段（體外細胞學、動物模型體內）驗證其生物學特性，從而提出了一整套基于現代生物信息學最新技術的“老藥新用”策略，并在RA治療中進行具體實施。

目前，基于神經內科用藥GTS-21（膽堿能受體激動劑）探討其治療RA的研究已經獲得國家自然科學基金的支持，進展順利。該項目是張鵬博士倡導的骨關節炎癥“老藥新用”策略的具體實施之一。

研究小組基于傳統中藥在RA治療中的特殊療效，從祖國醫學理論出發，結合現代藥理學的開發，從具有“舒筋活絡，祛風除濕”的中藥品種中提取若干有效成分，用于對RA療效的觀察。從臨床前研究的角度，采用體外細胞及動物模型為研究對象，進行了前期實驗。目前已經篩選到了若干有效的中藥活性成分，推進下一步的機理研究，最終期望將有活性的成分開發成RA治療中的療效確切的藥用品種。

本項目應用研發團隊核心成員楊家安博士具有自主知識產權的“蛋白質折疊碼”技術，可將復雜的蛋白空間三位信息轉成具有一維結構的編碼，并對藥物結合靶點特性以及藥物數據庫進行掃描比對，具有高效準確的特點。張鵬博士主導聯合楊家安博士等核心人員建立了一整套“基礎研究靶點—蛋白質折疊碼技術掃描分析—臨床用藥數據庫比對篩選—生物學有效性驗證”的“老藥新用”研發策略體系。

據張鵬介紹，該研究策略在目前原創性化學新藥研發遇到巨大挑戰的大背景下，可為新藥研發提供重要借鑒?！袄纤幮掠谩钡牟呗钥蔀樾滤帲?.6類新藥）的研發提供捷徑。由于“老藥”已經在臨床中廣泛應用，在安全性上具有保障，可避免藥物上市后因不良反應而“退市”的情況，同時可大大降低藥物研發成本及臨床用藥價格，進而惠及大眾。

除此之外，張鵬研究團隊對于膠原誘導性關節炎模型（CIA 模型）的創新性發現完善了對該疾病模型的認識。在此項研究中，張鵬發現了先前文獻中未作報道的CIA模型發病足爪關節破壞規律以及特殊的組織病理學表現，為全面了解CIA模型發病的特點和規律提供了實驗依據。通過放射學和組織學觀察，進一步完善了對其發病特點的描述，明確了該模型距下關節以及距舟關節為最早受累足爪關節的發病特點，在組織學觀察中發現了相鄰關節軟骨的“融合”現象，并在“融合”部位發現了新生血管的侵入以及新骨的生成，進而提出了“炎癥影響關節軟骨的終末分化狀態進而啟動軟骨內骨化”的科學假設，為研究RA發病中關節軟骨在骨贅生成中的作用提供了重要的實驗支持。相關成果發表在風濕病領域國際SCI期刊《Rheumatology International》 上。

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